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医疗特色/市级重点学科
肝脏肿瘤学 听觉医学 风湿病学 肝胆外科
泌尿外科 心血管内科 临床神经医学 消化系外科
肾脏内科 口腔内科 中医肝病 四肢显微外科
肺部肿瘤学 胸心外科 手外科 血液内科
小儿心血管科 烧伤外科 脊柱外科 眼科
安全输血 骨科（关节外科） 颅脑外科 内分泌代谢科
肿瘤病理学 整复外科 麻醉学 中医外科
儿童口腔科 老年精神病科 小儿呼吸内科（预备项目） 小儿血液科（预备项目）
肝脏肿瘤学
 承担单位：复旦大学医学院附属中山医院
第一负责人：汤钊猷
主要科室：
重点学科简介：复旦大学医学院(原上海医科大学)肝癌研究所，是我国主要的肝癌诊断治疗研究中心之一。其小肝癌的治疗和大肝癌缩小后切除5年生存率居国际领先水平，曾多次荣获国家及国际金奖。当今肝癌的复发与转移已成为亟待解决的制约着肝癌疗效进一步提高的关键。该所目前正以肝癌复发转移的研究、肝癌的生物治疗和基因治疗及外科新技术和肝移植的应用为重点。并以肝癌复发转移的分子机理及其防治为主攻方向，以期进一步提高肝癌防治水平。
听觉医学
 承担单位：复旦大学医学院附属眼耳鼻喉科医院?
第一负责人：王正敏
主要科室：
重点学科简介：复旦大学医学院(原上海医科大学)附属眼耳鼻喉科医院耳鼻喉科是国家重点学科，其耳显微外科、颅底和头颈外科居国际水平。该科新建听觉医学学科，主攻听觉重建，希望在进一步揭示人的正常和病理听觉系统的机理基础上，研究其失能后诊治对策和方法，从而更有效地造福广大聋疾病人。
风湿病学
 承担单位：上海第二医科大学附属仁济医院
第一负责人：陈顺乐
主要科室：
重点学科简介：仁济医院风湿病学科多年来，应用多种免疫学和分子生物学手段在早期诊断和鉴别诊断及其他如类风湿关节炎、硬皮病、干燥综合症等风湿病治疗方面很有特色。为提高风湿病的诊治水平，他们近年来的学科建设目标主要有应用DNA技术对风湿性疾病诊断、鉴别诊断以及并发症的防治具有重要意义的自身核抗原的分子克隆研究。
肝胆外科
 承担单位：第二军医大学附属东方肝胆外科医院
第一负责人：吴孟超
主要科室：
重点学科简介：在我国肝胆外科创始人之一吴孟超教授的带领下，该院肝癌手术成功率达到98.5%，小肝癌术后5年生存率达76%，居世界领先水平。早期肝癌和中晚期肝癌的诊治研究取得重大进展，复发性肝癌再切除治疗等技术已在全国推广。日前该院已开展分子病理学和分子生物学等高起点研究项目，以期大幅度提高肝胆肿瘤治疗的效果。
泌尿外科
 承担单位：上海市第一人民医院
第一负责人：唐孝达
主要科室：
重点学科简介：第一人民医院泌尿科在肾移植术前准备、肾移植手术及术后监测随访，免疫抑制调整应用方面，及对肾移植排斥诊治，术后感染等方面有其独特的技术，肾移植存活率接近国际先进水平。目前该科以肾脏移植为重点，正在开展肾移植术前HLA基因配性研究，这将使肾移植排斥率、感染率明显下降，使肾移植的长期存活率接近国际水平。
心血管内科
 承担单位：复旦大学医学院附属中山医院
第一负责人：杨英珍
主要科室：
重点学科简介：中山医院心血管内科是国家重点学科，该科在冠心病导管介入性诊断和治疗、病毒性心肌病研究等方面处于国内领先水平。目前该科以冠心病的介入性诊治为主攻方向，以冠脉腔内超声监测下选择性脉冲燃料激光消拴的研究为今后几年研究重点，希望通过努力，增强综合应用冠心病各种介入治疗方法的能力和用脉冲燃料激光治疗心肌梗塞，使冠脉再通率提高20%，从而大幅度提高我国治疗冠心病的整体水平和心肌塞的急救水平，并使心肌并地诊断标准得以确定。
临床神经医学
 承担单位：复旦大学医学院附属华山医院
第一负责人：吕传真
主要科室：
重点学科简介：临床神经医学是华山医院特色临床科室，也是我国南方神经系统疾病的主要诊疗中心。目前该科选择最常见的神经系统疾病----急性脑血管病为主攻方向。希望通过三年的努力，制定出缺血性中风、高血压性脑出血和蛛网膜下腔出血病患者最佳治疗方案，从而达到降低死亡率、提高治疗显效率的目的。
消化系外科
 承担单位：上海第二医科大学附属瑞金医院
第一负责人：李宏为
主要科室：
重点学科简介：瑞金医院消化外科近年来积极开展手术期营养支持、术后早期腹腔内化疗、过继性免疫治疗等新技术，使胃癌、结肠癌手术后5年生存率接近国际水平。七十年代中期始，该科通过总结近200例的急性坏死性胰腺炎的临床治疗经验，形成了一套行之有效的“个体治疗方案“使此病的存活率达到91．2％。在胆石症的治疗中，综合应用碎石、溶石或经胆道镜取石法外，且已将经腹腔镜胆囊切除术入常规手术之例。今后三年，该科以继续提高胃肠道癌肿和胰胆肝疾病的外科综合治疗为主攻方向，以期在这领域的综合防治中取得显著成绩。
肾脏内科
 承担单位：上海第二医科大学附属瑞金医院
第一负责人：陈楠
主要科室：
重点学科简介：瑞金医院肾脏内科将在今后几年主攻研究肾小管――间质疾病。由于肾小球和肾小管都埋在肾间质内，所以肾间质的病变会累及肾小球和肾小管，肾小球和肾小管的疾病又会伴有肾间质病变，且常为决定疾病转归预后的因素，所以进行该项研究对肾脏病诊断和治疗具有重要意义。该学科将形式开展先进检测方法以早期诊断肾小管间疾病及其病变部位，建立肾衰的早期诊断指标，并应用中西药物治疗。
口腔内科
 承担单位：上海第二医科大学附属第九人民医院
第一负责人：刘正 主要科室：
重点学科简介：口腔内科学为口腔医学专业中最基本的临床学科，第九人民医院口腔内科的防龋以及受龋牙的修复方面多次获上海市和国家教委奖，其研究水平和成果开发多优先于国内同行。其学科今后的主攻方面是以分子生物学的理论的技术研究龋牙、牙周病的病因，从而开出符合口微生态环境的防治措施，以先进的生物相容方法替目前的化学物理方法，提高临床治疗水平。
中医肝病
 承担单位：上海中医药大学附属曙光医院
第一负责人：王灵台
主要科室：
重点学科简介：曙光医院肝炎科30多年来，对慢性肝炎、肝纤维化等疑难杂症的治疗取得了显著疗效，并在国内率先运用“补肾为主”治疗慢性乙型肝炎，对抑制HBV复制的疗效达国内外先进水平。该科以改善肝功能、抑制肝炎病毒复制及阻断、逆转肝炎纤维化为主攻方向，以期提高诊治肝病的疗效。
四肢显微外科
 承担单位：上海第六人民医院
第一负责人：曾炳芳 主要科室：
重点学科简介：上海市第六人民医院骨科自60年代初取得世界上第一例断肢再植成功以后，30年来在显微外科技术的基础研究方面积累了丰富的经验，始终保持着再植成活率的世界领先地位。目前该科正以前臂与手缺失再造和全臂丛修复手功能重建为重点研究课题，以期为上肢功能缺失患者带来更大的福音。
肺部肿瘤学
 承担单位：上海市胸科医院等
成员单位：上海市肿瘤研究所
　　　　　上海市第一肺科医院
　　　　　上海市第六人民医院
第一负责人：廖美琳 主要科室：
重点学科简介：肺癌的发病率居本市各种肿瘤之首，并有继续上升的趋势。为此上海市胸科医院、市肿瘤研究所、第一肺科医院、第二肺科医院和第六人民医院五单位合作以肺癌为主攻方向，进行肺癌分子生物学特性的研究，并密切结合临床，探索一套适合国情的优化多方法学治疗方案，以期卓有成效地降低肺癌的病死率，提高生存期。
胸心外科
 承担单位：上海市胸科医院
成员单位：第二军医大学附属长海医院
第一负责人：周允中
主要科室：
重点学科简介：胸心外科由胸科医院和长海医院组合而成。其手术量和手术范围均在全国名列前茅。该科在治疗胸心疾病方面积累了丰富的经验，是我国高水平的胸心外科临床治疗基地。为解决长段气管切除后气道重建的世界性难题，以及为终末期肺、心疾病患者和冠心病患者提供更为有效的治疗，该科以气管代用品、心肺移植和冠脉外科作为今后三年的主攻方向，希望通过这些问题的攻克为更多的重症病人带来生活的希望。
手外科
 承担单位：复旦大学医学院附属华山医院
第一负责人：顾玉东
主要科室：
重点学科简介：华山医院手外科在我国手外科、显微外科领域一直保持着领先地位，多次获国家发明奖和国家及卫生部科技进步奖。该科在臂丛神经损伤诊治、组织移植和手功能重建等方面具有突出成就，在国内外享有盛誉。该科今后的主攻方向是寻找加速神经再生及防止手内在肌肌萎的新方法，保持臂丛神经损伤诊治的国际水平；提高组织移植的成活率和综合功能，将手部创伤的诊治水平提高到新的高度。
血液内科
 承担单位：上海第二医科大学附属瑞金医院
第一负责人：陈竺
主要科室：
该学科的研究内容：
　　1、白血病研究方面：在诱导分化治疗白血病分子机制研究的基础重点上，进一步指导白血病的临床治疗，提高缓解率，降低死亡率，提高生存率，并开展骨髓移植，从而提高白血病的冶愈率。
　　2、血栓与止血方面：：建立系统的止凝、纤溶检测方面，提高出血性疾病的诊断水平，特别是血友病A及其携带者的分子诊断水平，为血友病A的基因治疗提供初步实验结果。
　　该学科希望通过上述研究，继续保持诱导分化治疗白血病临床和基础研究方面的国际地位，争取有所新的突破。
小儿心血管科
 承担单位：上海第二医科大学附属新华医院
第一负责人：丁文祥
主要科室：
重点学科简介：新华医院小儿心血管专业在各种先心病的诊断及内、外科相嵌治疗方面有独创的经验。历年来共完成国家及市局级科研项目20余项，是我国小儿心血管专业的医疗及教学的重要基地，学科还与美国HOPE基金会及国际著名的小儿心血管中心波士顿儿童医院建有合作关系。学科的主攻方向是幼婴儿及各种复杂型先心病、重症型先心病的诊断和治疗。
烧伤外科
 承担单位：第二军医大学附属长海医院
第一负责人：夏照帆
主要科室：
重点学科简介：长海医院烧伤科是医教研一体的国家首批医学硕士、博士学位授予点及临床博士后流动站。1958年以来成功救治了大批重危病人，治愈率达98％。现承担国家及军队科研项目19项，获国家、军队科技进步奖15项。国际交流广泛。目前该科主攻方向是烧伤休克延迟复苏的损伤机理及综合复苏；基因治疗及复合皮等新技术治疗烧伤创面。
脊柱外科
 承担单位：第二军医大学附属长征医院
第一负责人：贾连顺
主要科室：
重点学科简介：由国内骨科界元老之一屠开元教授创立的上海长征医院骨科，经过几代人的努力，已成为国内有影响、特色明显、技术力量雄厚的学科。目前该学科整体水平处于国内先进，其中脊柱外科居国际水平，颈椎病已施术4000例、腰椎2500例，有效率达到95％，优良率80％。该学科今后的主攻方向为颈椎外科，应用分子生物学理论和生物力学手段，着重研究提高颈椎病的早期诊断准确率及手术的成功率，降低病残率，从而更有效地造福于广大颈椎病患者。
眼科
 承担单位：上海市第一人民医院
第一负责人：张皙
主要科室：
重点学科简介：第一人民医院眼科视网膜脱离的诊治有40多年历史。在我国著名眼科专家赵东生教授的带领下，手术成功率达98％，居国际水平。赵氏膜形成分级法，全氟丙烷气体的研制和应用，为提高复杂视网膜脱离玻璃体手术的治愈率打下基础。目前该科以视网膜脱离诊治为重点，研究引起及抑制增殖性玻璃体视网膜病变的多种因素；研究视网膜局部功能及色觉，以提高视网摸的解剖复位率及恢复视力。并以此推动其他眼科的治疗。
安全输血
 承担单位：上海血液中心
第一负责人：张钦辉
主要科室：
骨科（关节外科）
 承担单位：上海第二医科大学附属第九人民医院
第一负责人：戴克戎 主要科室：
重点学科简介：上海第二医科大学附属第九人民医院骨科在人工关节、骨折内固定、人体运动功能评定、形状记忆合金的医学应用等临床与基础研究方面处于国内领先水平，曾先后获国家及省部级科技进步奖15项。该学科目前以关节外科为主攻方向，希望通过临床与基础系列研究，在严重毁损关节的功能重建、人工关节晚期松动防治、急诊关节镜手术和经（近）关节骨折的治疗等方面取得突破，并在实践中培养出一批兼具临床与科研能力的两栖型人才。
颅脑外科
 承担单位：第二军医大学附属长征医院
第一负责人：卢亦成
主要科室：
重点学科简介：长征医院颅脑外科是全军神经外科中心、上海市神经外科研究所所在地。重点从事颅脑创伤的临床与基础研究，形成了一套颅脑创伤的临床救治方案，临床治疗效果达国际先进水平，并在脑和脊髓肿瘤、脑血管病等的外科治疗上也取得了显著成绩。该科希望通过加强颅脑损伤的临床和基础研究，特别是创伤性脑水肿和颅内高压的控制，进一步提高严重颅脑伤的临床救冶效果。
内分泌代谢科
 承担单位：上海市第六人民医院
第一负责人：贾伟平
主要科室：
重点学科简介：第六人民医院内分泌代谢科近年来以糖尿病为重点，在糖尿病的病因、发病机制及临床诊断治疗方面取得重大进展，特别是在II型糖尿病分子病因学研究处于国际先进水平、国内领先地位，多次获得上海市、卫生部和国家奖。目前该科以糖尿病为主开展糖尿病及其并发症的分子病因学，胰岛素抵抗制及血管并发症治疗等高起点研究，以期提高糖尿病的综合防治水平。
肿瘤病理学
 承担单位：复旦大学医学院附属肿瘤医院
第一负责人：施达仁
主要科室：
重点学科简介：复旦大学医学院(原上海医科大学)附属肿瘤医院病理科是全国最大的医院病理科。多年来一直是卫生部委托培养病理医师的基地，也是全国和上海市疑难病理会诊中心的骨干力量。肿瘤病理诊断达国内领先水平。该科以提高常见肿瘤病理诊断的正确性，加强新技术在病理诊断中的应用，建立分子病理学检测手段，为临床治疗和预后判断提供可靠指标为主攻方向，以期进一步提高肿瘤病理诊断的水平。
整复外科
 承担单位：上海第二医科大学附属第九人民医院
第一负责人：曹谊林
主要科室：
重点学科简介：上海第二医科大学附属第九人民医院整形外科是我国整形外科医、教、研主要中心之一，在器官再造，颅面畸形整复、淋巴水肿治疗等方面居国际水平。目前，该科以提高颅面畸形整复疗效为突破点，通过对颅、眶骨结构重组，神经、肌肉动力重建、生物修复材料应用等临床与基础研究，推动整形外科医疗水平的全面发展，为广大患者服务。
麻醉学
 承担单位：上海第二医科大学附属仁济医院等
成员单位：复旦大学医学院附属中山医院
　　　　　上海市第一人民医院
　　　　　上海市第六人民医院
第一负责人： 孙大金
主要科室：
重点学科简介： 麻醉学是二级临床学科，近年发展迅速，包括临床麻醉、急救复苏、重病监测和疼痛治疗四个领域。为了提高上海市麻醉学科整体水平，上海第二医科大学附属仁济医院、复旦大学医学院(原上海医科大学)附属中山医院、上海市第一人民医院和上海市第六人民医院等四个单位合作，以重危病人麻醉、临床麻醉药理以及多器官功能障碍为主攻方向，并建立上海市麻醉医师培训中心、麻醉质量控制中心，不断提高麻醉质量，保障麻醉安全，使上述四个医院的麻醉学科和医教研达到全国领先水平。
中医外科
 承担单位：上海中医药大学附属龙华医院
第一负责人：朱培庭
主要科室：
重点学科简介：上海中医药大学附属龙华医院中医外科三十年来从事急腹症、胆石病、乳腺病的中医防治研究。倡导胆病从肝论治的学说，承担国家级、市部级科研课题12项，获得市部科技进步奖10项，开发成功国家级中药新药――胆宁片，该学科配制成功的胆宁片、胆石净、养肝利胆口服液都能从肝细胞水平发挥防治胆石病的作用，学科主攻方向为胆道感染、胆石病、乳腺病的中医药防治。
儿童口腔科
 承担单位：同济大学附属口腔医院
第一负责人：石四箴
主要科室：
重点学科简介：儿童口腔是同济大学医学院(原上海铁道大学)附属口腔医院（筹）的重点特色专业。在儿童龋齿的修复、牙髓病和根尖周病的治疗、外伤牙的治疗及幼儿系列防龋措施等方面已处于国内领先地位。牙冠折断的修复、松动牙的固定、大面积龋损修复等新技术已进入国际行列。该学科的主攻方面是使儿童能形成正常的恒牙列，其间儿童时期的牙列分析研究和龋病活耀性的测试等同步于国外先进研究项目。
老年精神病科
 承担单位：上海市精神卫生中心
第一负责人：张明园
主要科室：
重点学科简介：人口的老龄化使老年精神卫生问题日益突出。上海市精神卫生中心的老年精神学科整体水平为全国领先，国内协作科研项目8项。该中心的遗传研究室，在国内精神科开展分子遗传学研究多年；神经电生理实验室建于1981年，设备较先进，实力雄厚。并具有国内最早最大的老年精神科临床基地，老年性痴呆及老年人群的社区动态资料完整，开展工作已历时8年，流行学研究成果已为国际公认。该中心具有一批老年精神医学骨干，是复旦大学医学院(原上海医科大学)、第二医科大学、同济大学医学院(原上海铁道大学医学院)精神及医学心理教育基地。
小儿呼吸内科（预备项目）
 承担单位：复旦大学附属儿科医院
第一负责人：孙波
主要科室：
小儿血液科（预备项目）
 承担单位：上海第二医科大学附属新华医院
第一负责人：顾龙君
主要科室：